Odpovím si sám, dál jsem nad tím koumal a řešení mám:
On ten MKVmerge totiž nemusí do MKV mergovat MKV+SRT ale klidně MP4+SRT. Tedy stačí vzít MP4 které mám ve full-hd a na telce hraje, vzít SRT, přes MKVmerge to spojit do MKV (trvá tak 2 minuty) a výsledné MKV přehrát na telce. Video zůstane původ...